Una web de análisis cienciométrico basado en la ciencia del objetivo mamífero de una vía de señalización de rapamicina en la enfermedad renal de 1986 a 2020 Parte 1
Mar 20, 2023
Fondo
La vía de señalización de la diana de la rapamicina en mamíferos (mTOR) es vital para la regulación del metabolismo, el crecimiento y la proliferación celular en el riñón. Este estudio tiene como objetivo mostrar los enfoques de investigación actuales y predecir las tendencias futuras en las vías mTOR enriñónenfermedadutilizando el análisis cienciométrico.
Métodos
Nos referimos a las publicaciones de la base de datos de Web of ScienceTM Core Collection (WoSCC). Se aplicaron los programas Carrot2, VOSviewer y CiteSpace para evaluar la distribución y la contribución de autores, institutos y países/regiones de extensos metadatos bibliográficos, mostrar los enfoques de investigación actuales y predecir tendencias futuras ennefropatíaáreas
Resultados
Hasta el 10 de julio de 2020 había 2.585 manuscritos sobre la vía de señalización de mTOR ennefropatíaen total, y cada manuscrito es citado en promedio 27,39 veces. El gran nombre, por supuesto, es Estados Unidos. Los puntos calientes de investigación incluyen "nefropatía diabética", "trasplante de riñón", "poliquistosis autosómica dominante".nefropatía", "complejo de esclerosis tuberosa", "carcinoma de células renales" y "autofagia".nefropatía", "trasplante renal", "carcinoma de células renales", "hamartín", "autofagia" y "complejo de esclerosis tuberosa".
Conclusiones
nefropatía diabética, trasplante renal, poliquística autosómica dominantenefropatía, el complejo de esclerosis tuberosa, el carcinoma de células renales y la autofagia son puntos críticos de investigación futuros mediante el uso de análisis cienciométricos. En el futuro, es necesario investigar estos campos.
Palabras clave
bibliometría;enfermedades renales; TOR serina-treonina quinasas; visor VOS; CiteSpace

Introducción
El objetivo de la rapamicina en los mamíferos es una serina-treonina quinasa conservada evolutivamente que detecta e integra varios factores ambientales para regular el crecimiento, la proliferación y el metabolismo celular. Desde el descubrimiento del modo de acción molecular objetivo principal de la rapamicina y el efecto de biología funcional, se ha reconocido que el objetivo de rapamicina en mamíferos (mTOR) impregna muchas áreas de la medicina, como la obesidad (1,2), la diabetes tipo 2 (3,4 ), trastornos genéticos (5), enfermedad del hígado graso no alcohólico (6-8), enfermedades neurológicas (9-11) y resistencia a la insulina (12). La creciente evidencia indica quemTORLa vía juega un papel importante en el trasplante, la homeostasis, el metabolismo y la regeneración en el riñón (13-16). Además, se relaciona con varias enfermedades como el complejo de esclerosis tuberosa (17), poliquistosisnefropatía(18), lesión renal aguda (19), carcinoma de células renales (20), poliquistosis autosómica dominantenefropatía(21), y enfermedad glomerular (22).
Bibliometric es un nuevo método para resumir el análisis estadístico de las publicaciones en una disciplina específica y un área temática, y además identificar un enfoque cálido en un campo de investigación mediante la creación de gráficos de información. Las ciencias sociales y el análisis cienciométrico utilizan varios programas biométricos, incluidos VOSviewer (23), CitNetExplorer, CiteSpace (24) e HistCite. A pesar de que se han obtenido conocimientos considerables, aún queda mucho por hacer en relación con la biomedicina. Schargus et al. identificó los artículos citados con más frecuencia en la investigación del ojo seco (25). Sugimoto et al. investigó factores relacionados con el sexo en exámenes médicos entre 2008 y 2016 (26). Fedewa et al. investigó el efecto del entrenamiento físico sobre la proteína C reactiva (27). El propósito de este estudio es explotar métodos bibliométricos para analizar tipos de literatura sobre la vía de señalización de mTOR ennefropatía. Investigamos la contribución de autores, instituciones y países/regiones, la evolución de ideas científicas, subtemas de investigación y manuscritos importantes en el campo de investigación específico mediante el uso de VOSviewer, CiteSpace y otras herramientas.
Métodos
Fuente de datos y estrategia de búsqueda
Los tipos de literatura relevantes se extrajeron de la base de datos Web of ScienceTM Core Collection (WoSCC) (Clarivate Analysis, Boston, EE. UU.). Buscamos publicaciones mediante la explotación de las palabras clave "mTOR o el objetivo de la rapamicina en mamíferos" y "riñón" de la base de datos WoSCC el 10 de julio de 2020. No se impusieron restricciones de idioma. Se descargaron "registro completo y referencias citadas" y los datos sin procesar se transformaron en formato TXT, lo que permitió el análisis de herramientas bibliométricas.

Análisis estadístico y presentación.
Se analizó la distribución y contribución de autores, institutos y países/regiones, y áreas de investigación de tipos de literatura, que se recuperó de la base de datos WoSCC. Aplicamos herramientas cienciométricas novedosas, como VOSviewer (Ludo Waltman, Centro de Estudios de Ciencia y Tecnología de la Universidad de Leiden, Países Bajos), Carrot2 (Dawid Weiss, Universidad Tecnológica de Poznan, Polonia) y CiteSpace (Chaomei Chen, Universidad de Drexel, EE. UU.) análisis de mapeo científico de extensos metadatos bibliográficos.
CiteSpace (Versión 5.6.R2 64-bit), que sirvió como un indicador del área más activa de investigación de la comunidad científica, se utilizó para capturar palabras clave con fuertes ráfagas de citas, analizar las tendencias temporales de las palabras clave, reconocer a los autores citados /referencias, y desarrollar mapas de visualización. Las categorías tópicas fueron analizadas por Carrot2. VOSviewer (Versión 1.6.11) se utilizó para reconocer asociaciones entre revistas y construir redes de colaboración, que se referían a agrupación de términos, países/regiones/instituciones/autores y sistemas de citas de autores/revistas citados.
Se extrajo un total de 2585 tipos de literatura de la base de datos WoSCC. Según la definición de CiteSpace, los mapas de conocimiento de visualización estaban compuestos por nodos y enlaces. Los diferentes nodos en las figuras representan elementos como países/regiones y autores, y los enlaces entre nodos indican relaciones de co-citas o colaboración/coocurrencia. Y se analizaron las publicaciones para construir el análisis de conglomerados, la red de citas conjuntas, las superposiciones de mapas duales y la zona horaria o la vista de línea de tiempo. Empleamos el proceso de "agrupamiento" de CiteSpace para identificar diferentes subtemas entre todos los artículos sobre "mTORennefropatía". Se utilizó VOSviewer para realizar análisis de densidad de citas conjuntas de revistas. Y se creó "Visualización de círculos" para extraer palabras clave significativas y revelar la influencia relativa de cada palabra clave de Carrot2.
Resultados
Publicaciones anuales y tendencia
Los datos se ingresan en el diagrama de flujo (Figura 1). Según el WoSCC, se publican un total de 2.585 manuscritos. La primera literatura sobre mTOR que cumplió con los términos de búsqueda se publicó en 1999. Solo después de 2005 los artículos sobre mTOR alcanzaron al menos un número de dos dígitos anualmente. Y el número de publicaciones era una actividad cada vez mayor por año. En los últimos 20 años, la proporción de vías mTOR en la investigación general de los riñones mostró una tendencia al alza (Figura 2A). En 2019, los tipos de literatura anuales aumentaron a 291 (Figura 2A). Estos documentos han sido citados 70.795 veces y cada artículo fue citado en promedio 27,39 veces.

Figura 1Análisis cienciométrico de la vía de señalización de mTOR en la enfermedad renal revelado en el diagrama de flujo. K, factor de escala; Z, z-dolor, una puntuación estándar del número de apariciones de palabras clave. mTOR, blanco mamífero de la rapamicina.
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Distribución y contribución de países/regiones e instituciones globales
Setenta países/regiones en total han publicado investigaciones sobre las vías de señalización de mTOR ennefropatía. Sucedió que una pieza de literatura fue publicada por autores de diversos países/regiones. Los 15 países/regiones más productivos produjeron 2,860 artículos (Figura 2B). Documentos sobremTORennefropatíase originó principalmente en los Estados Unidos. Y el número de artículos en los Estados Unidos fue mucho más alto que en los otros países/regiones. Estados Unidos publicó 923 artículos, seguido de China (n=373), Alemania (n=297), Italia (n=199), Francia (n=194), España ( n=181), Japón (n=126), Inglaterra (n=108) y Suiza (n=94) (Figura 2B). Según el mapa de calor elaborado por VOSviewer, EE. UU., Alemania, Italia y China tuvieron la densidad de publicación más intensa (Figura 2C).

Con el fin de obtener una mejor comprensión de las contribuciones de cada país/región al mTOR ennefropatíay las colaboraciones entre países/regiones, analizamos la base de datos WoSCC como datos. Según estos datos, nos enfocamos más en las colaboraciones internacionales, el número de citas y las veces que cada país/región cita el trabajo de otro. EE. UU. (n=32,984) y Alemania (n=8,579) ocuparon los dos primeros lugares en cuanto al número total de citas (Figura 2D). Aunque EE. UU., China, Alemania, Italia y Francia tienen el mayor número de publicaciones relacionadas con mTOR, el número promedio de citas por documento de Suiza y los Países Bajos es mucho mayor que el de los demás países (Figura 2D). China, Japón y algunas naciones europeas, como Alemania, Inglaterra y los Países Bajos, concentraron las mayores publicaciones entre 2008 y 2010, mientras que Italia, Polonia, Canadá, Suiza y España se publican principalmente entre 2013 y 2015 (Figura 2E). ).
Un total de 2.882 instituciones han publicado tipos de literatura. La red de citas entre estas instituciones fue analizada por el programa VOSviewer. La Tabla 1 reveló las 10 principales instituciones con más publicaciones. Entre estas organizaciones, cinco pertenecen a Estados Unidos, dos a Alemania, dos a España y una a Francia. La Universidad de Harvard investigó principalmentemTORennefropatíaen 2012-2013 (Figura 2F). En promedio, los artículos de la Universidad de Freiburg fueron citados 68,16 veces, mucho más que los demás (Figura 2G, H).


Figura 2Países/regiones involucrados en la vía de señalización mTOR en la investigación de enfermedades renales. (A) Número y porcentaje de publicaciones. (B) Los 15 principales países/regiones con las publicaciones más importantes. (C) Mapa de calor de publicaciones en países/regiones. (D) Citas promedio por artículo y número total de citas de los 15 principales países/regiones con la mayor producción. (E) El número de artículos en 70 países/regiones. (F) El número de manuscritos en diferentes instituciones. (G) Número de publicación y cita por artículo de las 20 instituciones más productivas. (H) Colaboración entre instituciones. mTOR, blanco mamífero de la rapamicina.
Distribución de manuscritos entre revistas
Los 2585 artículos se extrajeron de 730 revistas registradas de SCI-E. El número total de publicaciones y la red de citas entre estas revistas fueron analizados por el programa VOSviewer. El número mínimo de documentos de revistas se fijó en más de 5 para visualizar un mapa de 100 revistas (Figura 3A). Las 20 revistas más productivas publicaron 850 tipos de literatura, que fue uno de cada tres del número total de publicaciones. Las tres principales revistas con el número más evaluado de artículos distribuidos fueron Transplantation Proceedings, Transplantation y American Journal of Transplantation. Dieciocho de estas revistas se establecieron en el Reino Unido (n=5) y los Estados Unidos (n=13) (Tabla 2). New England Journal of Medicine (74.699), Nature Medicine (36.13), Nature Reviews Nephrology (20.711), Annals of Oncology (18.274) y European Urology (17.947) fueron las 5 revistas con mayor factor de impacto. Dado que Nature solo había publicado una literatura relacionada: Terminación de la autofagia y reformación de los lisosomas regulados por mTOR (28), incluso si el número de citas llegaba a 783, el programa VOSviewer no seleccionó la revista. La misma área de investigación de revistas tenía una tendencia a estar dentro del mismo grupo. El nodo en el gráfico representa una revista y los enlaces entre los nodos indican una relación de cocitación entre sí (Figura 3A). Existían tres grupos en el mapa de visualización de red y los elementos en diferentes grupos tienen diferentes colores (Figura 3B).


figura 3Redes de citas y colaboración entre organizaciones y autores. (A) Las 100 revistas más citadas con visualización en red. (B) Las 100 revistas más citadas con red de citas. (C) La coautoría entre los 70 autores más citados. (D) Los 70 autores más citados con visualización en red. (E) Las 20 ráfagas de citas más fuertes de referencias. (F) Una red de citas conjuntas de referencias.
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