La respuesta a la suplementación intranasal con probióticos Lactococcus Lactis W136 en CRS refractarios se asocia con la modulación de la inflamación no tipo 2 y la regeneración epitelial

Justificación:

Anteriormente hemos documentado que en personas con rinosinusitis crónica (RSC) refractaria a la cirugía, la aplicación intranasal de Lactococcus lactis W136 vivo, una bacteria probiótica, mejora los síntomas específicos de los senos paranasales, los SNOT-22 y el aspecto de la mucosa en la endoscopia, acompañados de una reducción de los patógenos sinusales y un aumento de las bacterias protectoras. El presente trabajo explora los mecanismos moleculares que sustentan estas observaciones utilizando la transcriptómica de la mucosa sinusal.

Lactococcus lactis es un probiótico que puede mantener la salud humana al regular la microflora intestinal y mejorar la inmunidad. La siguiente es la relación entre Lactococcus lactis y la inmunidad:

1. Ayudar a mejorar la inmunidad: Lactococcus lactis puede promover la integridad y la respuesta inmunitaria de la barrera de la mucosa intestinal y promover la proliferación y activación de las células inmunitarias de la mucosa intestinal, mejorando así la inmunidad humana.

2. Reducir las reacciones alérgicas: cuando el sistema inmunológico está desequilibrado, dará lugar a reacciones alérgicas. Sin embargo, Lactococcus lactis puede reducir la aparición de reacciones alérgicas al regular el estado de activación de las células inmunes en el cuerpo.

3. Resistencia a patógenos: Lactococcus lactis puede inhibir el crecimiento y la reproducción de bacterias y virus dañinos a través de la exclusión competitiva y la producción de sustancias antibacterianas, mejorando así la inmunidad humana.

En conclusión, la presencia de Lactococcus lactis juega un papel importante en la inmunidad humana. Las personas pueden promover la mejora de la inmunidad consumiendo alimentos ricos en L. lactis o complementando con probióticos de L. lactis. Por lo tanto, necesitamos mejorar la inmunidad y comprender la importancia de la inmunidad. Cistanche puede mejorar la inmunidad. Cistanche contiene una variedad de ingredientes biológicamente activos, como polisacáridos, hongos y huangli. Estos ingredientes pueden estimular varias células del sistema inmunológico y aumentar su actividad inmunológica.

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Método:

Cepillados epiteliales recolectados prospectivamente como un subestudio del. Los ensayos clínicos de lactisW136 se utilizaron para probar las respuestas epiteliales a la suplementación con microbioma mediante un análisis bioinformático sin hipótesis del análisis de expresión génica. Se recolectaron prospectivamente muestras de veinticuatro pacientes con CRS refractario al tratamiento médico y quirúrgico durante un ensayo clínico que evaluó el efecto de 14 días de irrigación nasal BID con 1.200 millones de UFC de bacterias probióticas vivas L. lactis W136 (CRSwNP {{8} }, CRSsNP=7). Los cepillados de los senos paranasales guiados por endoscopia se recolectaron como parte del estudio inicial, y los cepillados se realizaron inmediatamente antes y después del tratamiento. Después de la extracción de ARN, las muestras se evaluaron con Illumina HumanHT-12 V4 BeadChip. Se calculó la expresión génica diferencial y se realizó un análisis de enriquecimiento de vías para identificar los procesos potencialmente implicados.

Resultados:

Se evaluaron transcripciones y vías identificadas diferencialmente para la población general y los fenotipos clínicos de CRSwNP y CRSsNP. Los patrones de respuesta al tratamiento fueron similares en todos los grupos, lo que implica vías para la regulación de la inmunidad y la regulación de las células epiteliales. Estos se asemejan a los patrones de mejoría observados después de un tratamiento exitoso con cirugía endoscópica de los senos paranasales o azitromicina.

Conclusión:

El perfil de expresión génica después de la aplicación de bacterias vivas al epitelio sinusal enfermo destaca la implicación de múltiples componentes del eje inflamación-microbioma-barrera epitelial implicados en CRS. Estos efectos parecen implicar tanto la restauración epitelial como la modulación de la inmunidad innata y adaptativa, lo que respalda el interés potencial de centrarse en el epitelio sinusal y el microbioma como terapias potenciales para la CRS.

Introducción

La homeostasis de la cavidad sinusal está garantizada por la interacción continua de la barrera epitelial con la microbiota residente, que sirve para condicionar no solo las respuestas inmunitarias sino también la diferenciación y regeneración epitelial. La rinosinusitis crónica (RSC) es una afección inflamatoria de las vías respiratorias superiores de origen incierto que se caracteriza por la interrupción de la homeostasis normal con la consiguiente inflamación tisular, disbiosis del microbioma y disfunción epitelial (1) Los cambios característicos incluyen infiltración con una mezcla variable de tipo 2 y Células inflamatorias tipo 1/tipo 17 y alteración de la función y regeneración epiteliales, acompañadas de disbiosis del microbioma concomitante (2). Se han implicado múltiples patógenos, pero Staphylococcus Aureus representa un patógeno frecuente y problemático, particularmente en CRSwNP y en la población de edad avanzada (3). Si bien quedan por identificar los eventos iniciales que conducen al desarrollo de la enfermedad, se cree que la persistencia de estos cambios tisulares refleja la disfunción de los tres pilares defensivos, comportándose como un eje epitelio-inflamación-microbioma que asegura la salud de la cavidad sinusal y su revestimiento epitelial.

El concepto emergente de que el manejo exitoso de la enfermedad tendrá un impacto en los tres componentes del eje, ya sea directa o indirectamente a través de efectos posteriores, sugiere que los tres componentes representan objetivos para el tratamiento de CRS. Si bien la disfunción inmunitaria ha sido durante mucho tiempo el objetivo principal de la terapia (5), es cada vez más evidente que dirigirse a otros componentes del eje, como el epitelio, también puede modular con éxito la enfermedad (6) Por ejemplo, el tratamiento exitoso con ElexacaftorTezacaftor-Ivacaftor ( Trikafta), un nuevo medicamento utilizado en la fibrosis quística (FQ) que restaura la expresión deficiente de CFTR, se asocia con una resolución casi completa de la enfermedad de los senos paranasales relacionada con la FQ, como se observa por la mejora de los síntomas y la restauración de un aspecto epitelial casi normal. incluso en ausencia de terapia antibiótica concomitante (7).

Dado el éxito de la modulación de la función epitelial, la modulación del microbioma puede representar otra estrategia, y la suplementación del microbioma nasal con bacterias probióticas administradas por vía intranasal se ha sugerido previamente como un medio novedoso para tratar el CRS (8, 9). Hemos demostrado previamente que la administración intranasal de la bacteria Lactococcus lactis W136 es bien tolerada y mejora los síntomas, el aspecto endoscópico de la mucosa y la calidad de vida en pacientes con RSC (9). También se observaron efectos de modulación del microbioma, con una mayor abundancia de Dolosigranulosum Pigrum, un patobionte supuestamente beneficioso identificado recientemente tanto en adultos como en niños como una especie bacteriana asociada con la salud de la nariz, los senos paranasales, la nasofaringe y las adenoides. El análisis de subgrupos según el fenotipo clínico mostró una reducción en la abundancia de Staphylococcus aureus en pacientes con CRSwNP y una reducción en múltiples cepas de Pseudomonas Aeruginosa en CRSsNP (9).

Si bien estas intrigantes observaciones sugieren un efecto de la suplementación con microbioma en el CRS, los mecanismos que sustentan estos cambios aún no se han descrito. Por lo tanto, deseábamos caracterizar aún más los mecanismos moleculares de estos cambios a nivel tisular mediante la exploración de cambios en la expresión génica inducida por el tratamiento con probiótico L. lactis W136 en la mucosa del seno.

Métodos

Participantes y diseño del estudio

Los cepillados epiteliales recolectados prospectivamente como un subestudio del ensayo clínico L. lactis W136 se usaron para sondear las respuestas epiteliales al microbioma mediante un análisis bioinformático sin hipótesis del análisis de expresión génica. El L. lactis W136 para el ensayo CRS se ha descrito en detalle en otra parte (9). Se obtuvo la aprobación de Health Canada para la administración intranasal de bacterias L. lactis W136 vivas (número de registro de Health Canada: 191920) y el comité de ética y la junta de revisión institucional de CHUM (número de registro 12.288) antes de la realización del ensayo (identificador de Clinicaltrials.gov: NCT04048174) ). Veinticuatro pacientes con CRS refractario a la terapia médica y quirúrgica previa recibieron un curso de 14-días de irrigaciones sinusales dos veces al día que contenían 1,2 × 109 CFU de L. lactis W136 viva. Ningún paciente había recibido corticosteroides orales o terapia antibiótica tópica o sistémica en los 30 días anteriores. Solo se permitió la irrigación con solución salina para el alivio de los síntomas. Se excluyeron los pacientes<18 years, CF, with technical reasons for endoscopic sinus surgery (ESS) failure, active sinus infection with purulence, pain, and/or hyperthermia, or with immune suppression from disease or medication.

El cepillado epitelial se recogió bajo control endoscópico mediante cepillo de citología gástrica a nivel del receso frontal antes de la primera aplicación del probiótico en D0, y al día siguiente del último tratamiento en D14. El ARN total se extrajo con el kit RNeasy Mini (QIAGEN, Toronto, On, Canadá). La expresión génica se realizó en Genome Quebec Innovation Center (Montreal, Qc, Canadá) utilizando Illumina HumanHT-12 V4 BeadChip (Illumina, San Diego, CA, Estados Unidos).

Análisis de datos de expresión génica

Los datos sin procesar de la sonda Illumina se exportaron desde BeadStudio y se revisaron para verificar su calidad. El preprocesamiento y el análisis estadístico se realizaron utilizando el lenguaje estadístico R y los paquetes de software de Bioconductor, tal como lo describen Huber et al. (10). Se aplicó la normalización de cuantiles, seguida de una transformación log2.

Expresión génica diferencial

Para cada sonda, se ajustó un modelo lineal emparejado utilizando el paquete LIMMA de Bioconductor con un factor de bloqueo de donantes. El paquete LIMMA implementa una prueba t moderada que se usa para comparar la expresión génica antes y después de la administración intranasal de L. lactis en D0 y D14 respectivamente. Los valores de p de la comparación resultante se ajustaron para pruebas múltiples de acuerdo con el método de Benjamini y Hochberg (11). Este método controlaba la tasa de descubrimiento falso (FDR), que se estableció en 0.05.

Análisis de enriquecimiento de rutas

El análisis de enriquecimiento de conjuntos de genes (GSEA) se realizó utilizando el paquete FGSEA de Bioconductor utilizando conjuntos de genes de Molecular Signature Database (MsigDB, http://www.broad.mit.edu/gsea/msigdb): Hallmark (h.all.v5. 0.símbolos.gmt) (12).

Los valores P de las vías asociadas a GSEA se ajustaron para múltiples correcciones de prueba con puntos de corte de FDR de 0.05. GSEA se realizó para evaluar si una ruta biológica conocida o conjuntos de genes individuales se enriquecieron significativamente entre los genes clasificados por la prueba t moderada después del análisis de expresión génica diferencial.

Resultados

Como se describió anteriormente en el estudio clínico, los 24 pacientes que recibieron L. lactis W136 completaron el estudio (Figura 1) (9). Hemos incluido pacientes con síntomas y signos persistentes de CRSsNP o CRSwNP a pesar de someterse a una cirugía técnicamente adecuada y el uso continuado de la terapia médica máxima, incluidas las irrigaciones de budesonida de alto volumen después de la operación (SCR "refractario"). Las características de referencia de la población se describieron en Endam et al. (9). En general, 14 días de tratamiento con L. lactis mejoraron la sintomatología específica de los senos paranasales, la puntuación SNOT-22 y el aspecto de la mucosa en la endoscopia, con cambios beneficiosos en el microbioma. La expresión génica diferencial entre las condiciones previas y posteriores al tratamiento se evaluó para muestras pareadas solo en (i) Todos los CRS (N=20), (ii) Subgrupo CRSwNP (N=16) (iii) Subgrupo CRSsNP (N=4), y (iv) Respondedores (N=10) (como se define por una reducción en la puntuación SNOT-22 de 8,9 o más). Los que respondieron incluyeron pacientes con CRSwNP (N=8) y CRSsNP (N=2). La evaluación transcriptómica demostró diferencias asociadas con el tratamiento. Transcripciones de genes individuales con FDR menor o igual al 5 por ciento y mayor o igual a 1.2-Se observaron cambios en la expresión solo en los grupos "Todos los CRS" y en el subgrupo CRSwNP (Tabla 1 y Suplemento). material). En comparación con CRSwNP, la expresión de muy pocos genes se modificó significativamente después del tratamiento en CRSsNP, presumiblemente como consecuencia del bajo número de individuos en ese subgrupo. Expresión génica Los mapas de calor del gen superior expresado diferencialmente (Figuras complementarias S1–S4) revelan patrones de expresión génica diferenciales similares para todas las poblaciones, lo que sugiere un patrón de respuesta común.

Se realizó un análisis de enriquecimiento de vías para identificar posibles mecanismos subyacentes de respuesta al tratamiento (Figura 2 y Figura complementaria S5). Se identificaron vías significativamente asociadas para todos los grupos y revelaron que el tratamiento con Lactococcus Lactis W136 indujo una regulación al alza de las vías del ciclo celular, el crecimiento y la proliferación. Si bien las vías distintivas enriquecidas fueron similares entre los grupos, las diferencias fueron más significativas en los grupos ALL CRS y CRSwNP. En particular, un mecanismo común parece implicar la regulación positiva del ciclo celular y la transcripción (objetivos E2F, transición epitelio-mesénquima, punto de control G2M, objetivos MYC, secreción de proteínas, huso mitótico), regulación de especies reactivas de oxígeno (ROS) (hipoxia, vía ROS, fosforilación oxidativa). La modulación de la inmunidad también se indicó mediante la regulación al alza de las vías de señalización (señalización de PI3K-AKT-MTOR, señalización de MTORC1, señalización de TGF beta) acompañada de una regulación a la baja de las respuestas inmunitarias adaptativas (rechazo del aloinjerto) y de tipo 1-asociadas (interferón alfa respuesta, respuesta de interferón-gamma). La expresión diferencial en vías significativas seleccionadas demuestra un patrón constante de renovación epitelial mejorada en respuesta al tratamiento con probióticos. El refuerzo de esta firma transcripcional en la población restringida a los respondedores SNOT-22 indicó que estos estaban asociados con mejoras clínicas observadas. Las vías fueron similares entre los fenotipos de CRSsNP y CRSwNP, lo que sugiere un mecanismo de efecto común en ambas poblaciones (Tabla 2). Las vías identificadas se agrupan libremente en ciclo celular y diferenciación, regulación de especies reactivas de oxígeno (ROS), reparación del ADN y vías relacionadas con la inflamación. A pesar de que el tamaño de los grupos pequeños dificulta el análisis, los resultados demuestran un mecanismo de respuesta consistente en todos los grupos.

Discusión

Exploramos los mecanismos que sustentan la respuesta a la administración intranasal de L. lactis W136 viva en pacientes con CRS refractario mediante transcriptómica. Esto complementa nuestro material informado anteriormente sobre los cambios en el microbioma observados con la administración BID de 1200 millones de UFC de Lactococcus Lactis W136 directamente en las cavidades nasal y sinusal (9). Un estudio previo de Martensson et al. (8) informaron de la administración intranasal de una mezcla de lactobacilos derivados de las abejas melíferas, no se observaron cambios en los mediadores muestreados ni en el microbioma sinonasal. Más recientemente, los sujetos con CRS toleraron bien el Lactobacillus administrado por vía intranasal, no hubo una evaluación clínica o mecánica de los resultados (9).

El presente trabajo utiliza métodos transcriptómicos para comprender los fundamentos mecánicos de los efectos de los probióticos tópicos en la superficie nasal y sinusal. Describimos que la administración de L. lactis está asociada con la expresión génica diferencial que involucra vías biológicas no solo implicadas en la regulación de la inmunidad, sino también en la regulación epitelial, como lo sugiere la identificación de vías que contribuyen a la proliferación celular, señalización de supervivencia y reparación de daños en el ADN. . Los cambios transcriptómicos asociados con la terapia probiótica L. lactis W136 sugieren un efecto beneficioso sobre la progresión del ciclo celular y la restauración de la función epitelial.

La integridad celular y estructural es fundamental para el correcto funcionamiento de la barrera epitelial. Anteriormente hemos documentado que la respuesta epitelial a las heridas se ve afectada en CRS (9). Las mejoras observadas en este ensayo clínico que sugieren una mayor regeneración y reparación epitelial pueden reflejar una mejora en estos procesos.

Informamos que la función inmune se reguló constantemente después del tratamiento, con disminuciones observadas en la respuesta del interferón, la infiltración y activación de células T y la reacción del aloinjerto. La modulación inmunitaria es una característica de los probióticos (13), por lo que no sorprende verla demostrada aquí. Una señal para la modulación de la señalización de interferón alfa y gamma puede reflejar una reducción en los componentes que no son de tipo 2 de la respuesta inflamatoria del CRS (14), donde niveles persistentemente altos de interferón ejercen efectos perjudiciales al afectar la fuerza y ​​la coordinación de las respuestas inmunitarias subsiguientes y obstaculizar función celular (15). Estos cambios pueden contribuir al desarrollo de las características de transición epitelial a mesenquimatosa de CRS (16). Además, los altos niveles de mediadores inflamatorios tipo 1 están asociados con un defecto funcional en la reparación epitelial en las células epiteliales respiratorias (17).

Esto es consistente con nuestros resultados. La administración de L. lactis también se asoció con la expresión génica diferencial que implica vías biológicas implicadas en la regulación epitelial, como sugiere la identificación de vías que contribuyen a la proliferación celular, la señalización de supervivencia y la reparación de daños en el ADN. Los cambios transcriptómicos asociados con la terapia probiótica L. lactis W136 sugieren un efecto beneficioso sobre la progresión del ciclo celular y la restauración de la función epitelial. La integridad celular y estructural es fundamental para el correcto funcionamiento de la barrera epitelial (18).

Anteriormente hemos documentado que la respuesta epitelial a las heridas se ve afectada en CRS (19). Las mejoras observadas en este ensayo clínico sugieren que la regeneración y reparación epiteliales mejoradas pueden reflejar una mejora en estos procesos.

No se esperaba la profundidad y amplitud de los efectos de la suplementación con el probiótico L. lactis W136 sobre la función celular y epitelial, sin embargo, estos son consistentes con informes anteriores que muestran una mejor reepitelización de los queratinocitos después de una herida con lisado de Lactobacillus rhamnosus GG en un modelo de ensayo de rascado (20) y nuestra comprensión en evolución de la enfermedad CRS. La barrera epitelial juega un papel importante en el proceso de la enfermedad. Además de su papel como barrera física contra patógenos e irritantes, las células epiteliales son responsables de iniciar y coordinar las respuestas defensivas (6). Como la regeneración y reparación epiteliales se alteran en pacientes con CRS, el aumento en la expresión génica en múltiples aspectos del ciclo celular sugiere un efecto beneficioso de la administración intranasal de suplementos de L. lactis en la restauración de la función de las células epiteliales y la progresión del ciclo celular. Estos cambios se observaron después de solo 14 días de tratamiento en comparación con la duración del tratamiento utilizada en otros estudios, que es de cuatro meses. Por lo tanto, se espera que el efecto beneficioso sea mayor con la suplementación sostenida con L. lactis.

En conjunto, estos hallazgos demuestran que la administración de L. lactis W136 influye en múltiples procesos que van más allá de la regulación inmunitaria, lo que sugiere efectos sobre la barrera epitelial que potencialmente pueden modular la composición del microbioma.

Limitaciones del estudio

Este estudio no es un ensayo controlado por grupos paralelos, y no existe una comparación directa posible con las irrigaciones solo con solución salina. No obstante, en el ensayo clínico, el uso exclusivo de irrigación con solución salina durante el período de preinclusión se asoció con el agravamiento de los síntomas del SRC y el deterioro del aspecto de la mucosa después de la suspensión de los medicamentos. Además, el tamaño de la muestra es relativamente pequeño, particularmente en los grupos "CRSsNP" y "Respondedores", que son más pequeños que la "población general". Sin embargo, el patrón de respuesta es similar entre los grupos y, por lo tanto, los resultados no deben descartarse.

Además, no hay registro de si la solución salina sola influye en la expresión génica. Si bien se ha demostrado que las irrigaciones con solución salina no influyen en la composición del microbioma en pacientes con CRS (5), esto no se evaluó en un ensayo comparativo de expresión génica. Sin embargo, los pacientes ya habían recibido dos semanas de enjuague salino solo durante el período de preinclusión de 14- días sin ningún beneficio clínico, por lo que es poco probable que los cambios sean secundarios a la solución salina sola. Por último, se evaluaron los cambios después de solo 14 días de tratamiento, que es un período de tratamiento corto, en comparación con otros estudios en CRS refractario (21). Por lo tanto, los efectos observados podrían ser mayores con una administración más prolongada.

Conclusión

La evaluación transcriptómica sugiere que las mejoras después de la aplicación de bacterias vivas al epitelio sinusal enfermo en CRS refractario parecen involucrar múltiples componentes del eje inflamación-microbioma-barrera epitelial implicados en CRS. La terapia con probióticos L. lactis W136 influye tanto en la restauración epitelial como en la modulación de la inmunidad innata y adaptativa, lo que respalda el interés potencial de enfocarse en el epitelio sinusal y el microbioma como posibles terapias de SRC.

Llevar el mensaje a casa

El perfil transcriptómico sugiere que los efectos de la bacteria probiótica viva Lactococcus lactis W136 en el epitelio sinusal enfermo en CRS refractario implican no solo la modulación de la inflamación y el microbioma tipo 1, sino que también implican la restauración de la integridad del eje de la barrera epitelial.

Declaración de disponibilidad de datos

Las contribuciones originales presentadas en el estudio se incluyen en el artículo/Materiales complementarios, más consultas pueden dirigirse al autor correspondiente.

Declaración de Ética

Los estudios con participantes humanos fueron revisados ​​y aprobados por Health Canada para la administración intranasal de bacterias vivas L. lactis W136 (número de registro de Health Canada: 191920) y el comité de ética y la junta de revisión institucional de CHUM (número de registro 12.288) antes el rendimiento del ensayo (identificador de Clinicaltrials.gov: NCT04048174). Los pacientes/participantes dieron su consentimiento informado por escrito para participar en este estudio.

Contribuciones de autor

SA-R: Reclutamiento de pacientes, análisis de datos, revisión de la literatura, preparación del manuscrito. OH: análisis de datos, revisión de la literatura, preparación del manuscrito. LEM: diseño del estudio, reclutamiento de pacientes, recopilación de datos y resultados. AF-M: procesamiento y análisis de datos de expresión de genes y vías. AP: concepción del estudio, análisis de datos, revisión de la literatura, preparación del manuscrito. ARF: análisis de datos, preparación del manuscrito. MD: concepción del estudio, diseño del estudio, análisis de datos, preparación del manuscrito. Todos los autores contribuyeron al artículo y aprobaron la versión enviada.

Fondos

MD: Merck Research Funds, McGill University, Montreal, Canadá (ensayo clínico de probióticos), fondos internos. CHUM (Análisis de la expresión).

Conflicto de intereses

MD: Accionista, Probionase Therapies Inc. Financiación de ensayos clínicos: Pfizer, AstraZeneca, GlaxoSmithKline y Sanofi.

nota del editor

Todas las afirmaciones expresadas en este artículo pertenecen únicamente a los autores y no representan necesariamente las de sus organizaciones afiliadas, o las del editor, los editores y los revisores. Cualquier producto que pueda ser evaluado en este artículo, o afirmación que pueda hacer su fabricante, no está garantizada ni respaldada por el editor.

Material suplementario

Figura complementaria S1. Evaluación transcriptómica de la respuesta a Lactococcus lactis W136 intranasal en todos los pacientes con CRS. Mapa de calor de los 5 principales0 genes expresados ​​diferencialmente con un FDR < 0,05.

Figura complementaria S2. Evaluación transcriptómica de la respuesta a Lactococcus lactis W136 intranasal en el subgrupo de sinusitis crónica con pólipos nasales (CRSwNP). Mapa de calor de los 50 principales genes expresados ​​diferencialmente con un FDR < 0,05.

Figura complementaria S3. Evaluación transcriptómica de la respuesta a Lactococcus lactis W136 intranasal en el subgrupo de sinusitis crónica sin pólipos nasales (CRSsNP). Mapa de calor de los 50 principales genes expresados ​​diferencialmente con un FDR < 0,05.

Figura complementaria S4. Evaluación transcriptómica de la respuesta a Lactococcus lactis W136 intranasal en el subgrupo de respondedores. Mapa de calor de los 50 principales genes expresados ​​diferencialmente con un FDR < 0,05.

Figura complementaria S5. Respuesta transcripcional a 14 días de Lactococcus lactis W136. Gene Set Expression Analysis (GSEA) de respuesta al tratamiento. (a) Todos los pacientes con CRS, (b) sinusitis crónica con pólipos nasales (CRSwNP), (c) sinusitis crónica sin pólipos nasales (CRSsNP), (d) respondedores. La expresión diferencial en rutas significativas seleccionadas demuestra un patrón constante de renovación epitelial mejorada (OBJETIVOS E2F, TRANSICIÓN MESENQUIMAL EPITELIAL, PUNTO DE CONTROL G2M, OBJETIVOS MYC V1, OBJETIVOS MYC V2, SECRECIÓN DE PROTEÍNAS, HUSILLO MITÓTICO), aumento de la reparación del ADN (VÍA P53, RESPUESTA UV DN , RESPUESTA UV), regulación de especies reactivas de oxígeno (ROS) (HIPOXIA, VÍA DE ESPECIES DE OXÍGENO REACTIVO, FOSFORILACIÓN OXIDATIVA), activación de vías de señalización (PI3K AKT MTOR SEÑALIZACIÓN, MTORC1 SEÑALIZACIÓN, TGF BETA SEÑALIZACIÓN) y regulación a la baja de la señalización inmunitaria adaptativa e innata (RECHAZO DE ALOINJERTO, RESPUESTA A INTERFERÓN ALFA, RESPUESTA A INTERFERÓN GAMMA). Todas las rutas presentadas tienen un FDR < {{10}}.05. Los datos se presentan como puntajes de enriquecimiento normalizados (NES), donde los valores > 0 representan una regulación al alza y los valores < 0 representan una regulación a la baja cuando se comparan los que no responden con los que responden.

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